1. Compram aviões de maneira mais barata (se aproveitando de momentos nos quais o mercado está difícil para os produtores de aviões, normalmente);
2. Compram aviões novos que gastam menos combustível (suas frotas são bem mais novas do que as das companhias comuns);
3. Operam somente um tipo de avião, o que reduz sensivelmente custos de treinamento para todo o pessoal, de pilotos e atendentes de vôo ao pessoal de manutenção e atendimento;
4. Eliminam luxos: na RayanAir, por exemplo, os bancos não reclinam, só isso reduz o custo inicial de compra e o custo de manutenção do avião, também não existem bolsões nas poltronas, o que reduz o custo de limpeza;
5. Atendentes geralmente são pessoas novas e que estão dispostas a ganhar menos, também são pouco treinadas quanto à hospitalidade, além disso as atendentes também trabalham na limpeza do avião e nos serviços de terra;
6. Comida e bebida quase nunca são gratuitas;
7. Partes dos aviões são usadas como locais de posicionamento de peças publicitárias;
8. Usam os aeroportos mais baratos para elas, em geral esses são aeroportos menos conhecidos, menores e menos bem localizados (o que normalmente encarece o deslocamento até o aeroporto para os usuários, mas o preço parece compensar);
9. Os aviões tendem a voar (e portanto a ganhar dinheiro) o máximo de tempo possível, parando somente para as manutenções necessárias, geralmente não leva mais de 45 minutos entre tocar o solo e partir novamente, o que para uma companhia normal é quase impossível. Por exemplo, essas companhias raramente tem assentos pré-marcados, assim as pessoas tendem a chegar mais cedo para pegar os melhores lugares;
10. Boa parte delas opera sem a existência de conexões, pois isso encarece o serviço devido à necessidade de pessoal em terra para tratar as bagagens, a maior complexidade do sistema de passagens e a problemas de conexão que obrigam a empresa a pagar pela estadia do passageiro;
11. A automação toma conta: é quase impossível comprar um bilhete com alguém, isso ocorre para reduzir os custos com pessoal e com erros;
12. Elas evitam usar o equipamento do aeroporto (como aquelas passarelas que levam até a porta) e preferem usar as escadas e fazer com que as pessoas caminhem até o local do vôo;
13. Geralmente trabalham com turistas de diversão e não de negócios, que tendem a ser mais exigentes quanto ao serviço;
14. Tem pouquíssimos trabalhadores filiados a sindicatos, o que faz com que seus custos com pessoal sejam menores;

Como resultado disso as margens de lucro são absurdamente maiores do que as das companhias tradicionais:

Enquanto isso, no Brasil, com um mercado extremamente regulado, pode custar mais de 300 dólares para andar 45 minutos de avião, indo de Altamira para Belém, no Pará, Viagens de uma hora e pouco chegam a custar mais de 500 dólares (saindo de Porto Alegre e indo para Montevideo, por exemplo).

A competição só é ruim para quem compete, para o público em geral é maravilhosa, reduz custos, aumenta a quantidade de opções disponível e faz a maioria das pessoas mais felizes.

Com informações daqui.